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2021-06-09 08:49  作者:作物所2021-06-09  作者:作物所

  近日,作物所科技人员在著名期刊《Horticulture Reaearch》(TOP1区,IF5.404)上发表了高质量南药巴戟天基因组研究成果,成功组装巴戟天染色体级高质量基因组。作物所王继华研究员、徐世强博士为共同第一作者。
  巴戟天具有1700余年药用历史,是我国著名的“四大南药”之一。广东省的巴戟天栽培面积最大,产量占全国总产量的90%以上,历史道地产区在我省肇庆市,其中高要巴戟天获得国家“道地药材”和“中华人民共和国地理标志保护产品”认证。揭示中药材的道地性一直以来是南药领域的研究热点。长期以来,高质量的巴戟天基因组图谱的缺乏制约了其功能基因组学和分子育种的发展,本研究将为巴戟天的遗传改良以及活性成分的合成调控提供了重要的理论基础。
  近年来,作物特色作物与南药研究室在“院人才培养基金”及“所长基金”等资助下启动了以巴戟天为代表的“道地南药基因组计划”。本次与亚热带jrs直播 网球生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学等多家单位和企业联合,采用Oxford Nanopore三代测序(130X)和Hi-C 技术(115X)对广东省高要市主要栽培品种“高戟3号”进行测序,首次组装巴戟天染色体级高质量基因组。组装的参考基因组大小为484.85 Mb,杂合度为1.32%,contig N50为4.21 Mb,scaffold N50为40.97 Mb,BUSCO指数为97.02%,注释获得27,102个蛋白质编码基因。同时,本研究还对蒽醌类、环烯醚萜类和多糖类成分生物合成的结构基因的表达模式进行了分析。
  原文链接:https://www.nature.com/articles/s41438-021-00551-w

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